Guarda, per quello che conosco non esistono caricabatterie con uscite differenziate... posso pensare però alla Victron che utilizza un approccio particolare, per ovviare al problema che hai appena evidenziato, in quanto permette comunque di caricare batterie di tipo diverso! Le batterie servizi sono quelle che necessitano di maggiore accuratezza nella ricarica, e anche amperaggi più elevati, mentre per la batteria motore sono sufficienti anche 4Ah.. quindi sulle batterie servizi si arriva con il caricabatterie, e poi per caricare la batteria motore si usa questo prodotto:
http://www.balmar.net/page20-Duocharge.html
http://www.balmar.net/PDF/Duo%20Charge%20Manual.pdf
che è configurabile indipendentemente dalle batterie servizi! Il prodotto è distribuito dalla
http://www.victronenergy.it/
Sicuramente fa al caso tuo! e così il problema è risolto!
Ciao!