Vi è mai capitato?

[Temasek]

Da come hai descritto il problema,
sembra che si entri aria, nel filtro della presa a mare.
E' posto sopra la linea di galleggiamento e per far innescare il flusso dell'acqua, deve essere a tenuta di vuoto.
Molto probabilmente la guarnizione del coperchio è danneggiata o montata male ( verifica), visto che ci sei, controlla anche la tenuta dei tubi e delle fascette.